Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lig1P37913 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms