Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PpargP37238 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PpargP37238 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PpargP37238 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PpargP37238 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PpargP37238 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms