Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Grin2aP35436 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2aP35436 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2aP35436 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms