Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sftpa1P35242 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sftpa1P35242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms