Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ptk2P34152 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ptk2P34152 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms