Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc5P32043 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc5P32043 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms