Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cd28P31041 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd28P31041 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms