Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tacr1P30548 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tacr1P30548 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms