Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VtnP29788 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VtnP29788 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VtnP29788 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VtnP29788 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VtnP29788 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VtnP29788 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VtnP29788 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms