Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nedd8P29595 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nedd8P29595 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms