Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp1P29452 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp1P29452 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp1P29452 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp1P29452 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms