Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Celf1P28659 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms