Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BgnP28653 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BgnP28653 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BgnP28653 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BgnP28653 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BgnP28653 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BgnP28653 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BgnP28653 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms