Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Etv4P28322 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms