Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LoxP28301 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LoxP28301 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LoxP28301 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LoxP28301 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms