Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2-DMaP28078 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-DMaP28078 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms