Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CebpbP28033 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CebpbP28033 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CebpbP28033 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CebpbP28033 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CebpbP28033 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CebpbP28033 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms