Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RdxP26043 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RdxP26043 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RdxP26043 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RdxP26043 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RdxP26043 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RdxP26043 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RdxP26043 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RdxP26043 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RdxP26043 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RdxP26043 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms