Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZfaP23607 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZfaP23607 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms