Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxb9P20615 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb9P20615 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms