Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pou5f1P20263 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pou5f1P20263 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms