Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NefhP19246 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NefhP19246 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NefhP19246 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NefhP19246 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NefhP19246 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NefhP19246 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NefhP19246 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NefhP19246 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NefhP19246 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NefhP19246 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms