Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rps6ka1P18653 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rps6ka1P18653 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms