Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P18533 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P18533 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P18533 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P18533 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P18533 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P18533 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
P18533 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18533 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P18533 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
P18533 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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