Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18524 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18524 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18524 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18524 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P18524 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P18524 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms