Protein–RNA interactions for Protein: P18121

Prl3d1, Prolactin-3D1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d1P18121 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prl3d1P18121 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prl3d1P18121 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prl3d1P18121 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prl3d1P18121 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prl3d1P18121 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prl3d1P18121 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms