Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Defa-rs1P17533 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa-rs1P17533 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms