Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptan1P16546 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptan1P16546 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms