Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf1P15314 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Irf1P15314 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms