Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scd1P13516 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scd1P13516 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scd1P13516 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms