Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Calb1P12658 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Calb1P12658 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Calb1P12658 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms