Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtcP11725 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtcP11725 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtcP11725 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtcP11725 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
OtcP11725 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
OtcP11725 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OtcP11725 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OtcP11725 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OtcP11725 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OtcP11725 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OtcP11725 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OtcP11725 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms