Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Itga5P11688 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms