Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lamp1P11438 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lamp1P11438 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms