Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fv4P11370 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fv4P11370 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms