Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FlgP11088 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FlgP11088 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FlgP11088 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FlgP11088 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FlgP11088 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FlgP11088 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FlgP11088 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FlgP11088 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FlgP11088 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FlgP11088 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms