Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Spp1P10923 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spp1P10923 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms