Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxd4P10628 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxd4P10628 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms