Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P10404 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P10404 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P10404 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P10404 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P10404 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P10404 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P10404 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P10404 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms