Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccl2P10148 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccl2P10148 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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