Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Schip1P0DPB4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Schip1P0DPB4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms