Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CatspereP0DP43 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CatspereP0DP43 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms