Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Calm2P0DP27 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Calm2P0DP27 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms