Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxa6P09092 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa6P09092 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms