Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxb5P09079 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxb5P09079 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hoxb5P09079 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Hoxb5P09079 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxb5P09079 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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