Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col4a2P08122 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col4a2P08122 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms