Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04213 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04213 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04213 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04213 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P04213 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms