Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01804 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01804 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01804 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01804 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01804 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01804 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01804 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms