Protein–RNA interactions for Protein: P01655

Ig kappa chain V-III region PC 7132, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01655 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01655 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01655 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01655 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01655 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01655 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01655 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms