Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01652 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01652 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01652 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01652 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01652 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01652 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01652 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01652 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01652 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
P01652 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01652 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01652 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01652 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01652 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01652 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms